日中友好環境保全センターには、プロジェクトとは別に、環境分野における資金協力連携を促進するための長期専門家が派遣されています。国家環境保護部の日中協力プロジェクト事務局（日中友好環境保全センター内に設置）に所属し、有償資金協力と技術協力等及びその他の協力との連携を促進することを通じてより効果的総合的な環境協力が実現されるよう活動しています。2003年3月から専門家の派遣が開始され、これまで2人の専門家の派遣が行われています。日中友好環境保全センターとの関係では、次のような活動をしています。 1. 環境資金協力案件の評価、関係する地方行政官への研修など、環境保護部の持っている課題について共同で関連業務を行っています。 2. 現在、中国の地方大学を対象として有償資金協力による人材育成事業が実施されていますが、センターを交流のプラットホームとしたこれらの大学と日本の大学・研究機関等との環境交流促進のための連携可能性等について調整しています。 3. プロジェクトの課題に沿った資金協力案件との連携についてその調整と実施をサポートしています。